Является аэродромом совместного базирования — помимо гражданской авиации, используется авиацией ФСБ РФ, МЧС РФ, Минобороны РФ. В частности, здесь базируется 398-я отдельная транспортная эскадрилья Балтийского флота ВМФ РФ (самолёты Ан-24, Ан-26).

Калининградский аэропорт принимает практически все типы воздушных судов российского производства, имеет допуски на обслуживание самолетов «Boeing», «Airbus» и их модификаций, а также большинства моделей воздушных судов бизнес авиации: «Embraer», «Falcon», «Gulfstream», «Challenger» и других.

Осенью 2014 года начались строительно-монтажные работы в рамках второй очереди реконструкции аэропорта «Храброво», в результате которой произойдет удлинение взлетно-посадочной полосы до 3,35 км и расширение перрона.

В настоящее время полеты в аэропорт Калининграда выполняют российские и зарубежные авиакомпании, такие как: «Аэрофлот», «Россия», «Трансаэро», «Ютэйр», «S7», «Оренбургские авиалинии», «Уральские авиалинии», «Белавиа», «Узбекистон хаво йуллари», «ИЖАВИА», «Северсталь», «Нордавиа — региональные авиалинии», «АкБарсАэро», «МАУ», «Ellinair», «AirBerlin», «Vueling» и др.